Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdm1Q9CQK3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms