Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nudt21Q9CQF3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms