Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RTRAFQ9CQE8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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