Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms