Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5aQ9CQD1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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