Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q9CQC3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms