Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Use1Q9CQ56 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms