Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Krt88Q9CPR6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Krt88Q9CPR6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt88Q9CPR6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Krt88Q9CPR6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Krt88Q9CPR6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms