Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Prpf8Q99PV0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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