Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nup155Q99P88 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nup155Q99P88 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms