Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl3Q99N95 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl3Q99N95 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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