Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms