Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a6dQ99N07 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms