Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ms4a4dQ99N05 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ms4a4dQ99N05 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms