Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SrrtQ99MR6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms