Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nus1Q99LJ8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nus1Q99LJ8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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