Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms