Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1bQ99JY6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms