Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ddb2Q99J79 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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