Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clip1Q922J3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clip1Q922J3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms