Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms