Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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