Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc12Q8K5B8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc12Q8K5B8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc12Q8K5B8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc12Q8K5B8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc12Q8K5B8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc12Q8K5B8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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