Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r72Q8K3N7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms