Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vrk3Q8K3G5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms