Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ssh3Q8K330 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssh3Q8K330 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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