Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Stn1Q8K2X3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Stn1Q8K2X3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Stn1Q8K2X3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stn1Q8K2X3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stn1Q8K2X3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms