Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire2Q8K1S6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms