Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek9Q8K1R7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek9Q8K1R7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms