Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms