Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms