Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ercc8Q8CFD5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms