Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc17Q8CE13 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms