Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E4f1Q8CCE9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E4f1Q8CCE9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms