Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubqln3Q8C5U9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms