Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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