Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pggt1bQ8BUY9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms