Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms