Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms