Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpp38Q80UU2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpp38Q80UU2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms