Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms