Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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