Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms