Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnih3Q6ZWS4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms