Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttbk1Q6PCN3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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