Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms