Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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