Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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CltbQ6IRU5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CltbQ6IRU5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CltbQ6IRU5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms