Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tpm4Q6IRU2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Tpm4Q6IRU2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Tpm4Q6IRU2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Tpm4Q6IRU2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Tpm4Q6IRU2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tpm4Q6IRU2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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