Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Krt40Q6IFX3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Krt40Q6IFX3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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